С 1 июля 2014 года в Казахстане на добровольной основе появилась возможность выписывать счета-фактуры в электронном  виде (ЭСФ). Использование информационной системы электронных счетов-фактур (ИС ЭСФ) осуществляется на бесплатной основе. Для того, чтобы выписывать ЭСФ необходимо зарегистрироваться в ИС ЭСФ и стать участником данной системы. Выписка ЭСФ производится в ИС ЭСФ, администратором которой является Комитет Казначейства Министерства финансов Республики Казахстан.

В случае, если налогоплательщик выписал счет-фактуру, как на бумажном носителе, так и в электронном виде, то оригиналом (подлинником) является документ, содержащийся в ИС ЭСФ.  ЭСФ может иметь копии на бумажном носителе или в электронном виде.

В соответствии с нормами статьи 412 Налогового кодекса счет-фактура в электронной форме выписывается в информационной системе электронных счетов-фактур в порядке и по форме, которые определены уполномоченным органом (по новой версии).

            Основные преимущества при выписке ЭСФ:

• Увеличение срока выписки ЭСФ на 15 дней, по сравнению со сроком выписки  счетов-фактур на бумажном носителе, который составляет 7 дней.
• Возможность выписывать ЭСФ в иностранной валюте.
• Возможность делегирования прав по выписке счетов-фактур своим работникам.
• Возможность управления ЭСФ, выписанными структурными подразделениями юридического лица.
• Возможность не предоставления реестра по реализованным товарам, работам, услугам (300.07), в случае если Вы все счета-фактуры выписываете в электронном виде.
• Возможность не предоставления реестра по реализованным товарам, работам, услугам (300.08), в случае если Вам все счета-фактуры выписаны в электронном виде.
• Экономия бумаги и экономия средств на изготовление печати.
• Оперативная доставка ЭСФ получателю вне зависимости от его местонахождения, а также возможность быстрого обмена сообщениями в ИС ЭСФ между покупателем и поставщиком.
• Возможность исключения ошибок, поскольку ИС ЭСФ производит проверку форматно-логического контроля.
• Исключение дополнительного оформления отдельных первичных бухгалтерских документов (товарно-транспортной накладной, счета на оплату, а также возможность указания в ЭСФ отдельных реквизитов договора).
• Автоматическое формирование счета на оплату с ИС ЭСФ в ИС «Казначейство-клиент» в случае, если получателем товаров, работ, услуг является государственное учреждение, что обеспечивает прозрачность движения электронных финансовых документов к оплате.